טוויין כתב את הנסיך ואת האפיפיור באמצע כתיבתו על "הרפתקאות האקלברי פין". הפסקה ברורה מן backwoods האמריקאי, את הנסיך ואת Pauper מוגדר באנגליה ומשתמש דיאלקט דומה יותר שייקספיר מאשר Huck Finn. למרות ההבדל בסגנון, עם זאת, קולו של טוויין ניכר עדיין בפרשנות הפוליטית של הספר. הרומן מספר את סיפורו של המלך ההיסטורי אדוארד השישי, שמחליף חיים עם עניים צעירים במשך כמה שבועות. כמו אדוארד חוויות הקושי של החיים ככזה, הוא מזהה את העוולות של החוק האנגלי ולאחר מכן עובד כדי לתקן אותם כמו מלך. הסיפור הוא סיפור מרגש של זהות מוטעית ומבוא נפלא להיסטוריה האנגלית של המאה השש עשרה.
אף על פי שהנסיך והפופר הוא ספר בדיוני, הוא מסתמך על פרטים היסטוריים אמיתיים על המלוכה האנגלית על הגדרתה ועל הדמויות. המלך הנרי השמיני, הנסיך אדוארד (מאוחר יותר המלך אדוארד השישי), ורוב האצילים האחרים היו דמויות היסטוריות אמיתיות. הפרטים של טוויין על משפחת המלוכה נחקרו בקפידה, אך ייתכן שיש צורך ברקע נוסף כדי לשפר את ההבנה של התלמידים. אביו של אדוארד, הנרי השמיני, הוא אולי הידוע לשמצה ביותר עבור שש הנשים שלו. הנרי חיפש בן שיבטיח יורש זכר לשושלת טיודור, וכאשר שתי נשותיו הראשונות ילדו רק לבנות, הוא השתדל להינשא שוב. בהיותו ראש הכנסייה של אנגליה ושינוי הדת הלאומית, התגרש אנרי מאשתו הראשונה והוציא להורג את השני. אף על פי שאשתו השלישית, ג'יין סימור, נישאה לו אדוארד, מתה ימים ספורים לאחר הלידה. הנסיך אדוארד, הבן היחיד, זכה למלך על ידי המלך. היסטוריונים מתארים את אדוארד כאינטליגנטי וחסיד. לרוע המזל, שלטונו היה קצר. הוא הפך למלך בשנת 1547 בגיל תשע ומת משחפת בשעה 15. בעוד המלך, הוא היה צעיר מדי כדי לשלוט באמת, נוהלה בעיקר על ידי מגן האדון הארל של הרטפורד, לאחר מכן הוצא להורג והחליף על ידי ארל וורוויק.
טוויין לוקח כמה חירויות עם ההיסטוריה האנגלית, אבל מבסס את הדמויות שלו ואת פעולות אישיות על חשבונות היסטוריים גסים. אף על פי שהיסטוריונים מודרניים מציגים את הרטפורד באור ביקורתי, בימיו של טוויין, הוא זכה לשבחים כאלוף של האנשים הפשוטים. הוא ואדוארד הצעיר נתפסו אפוא כבעלי לב עדין יותר ובלתי הוגנים יותר מאשר יחסי השלטון שלהם. במכתב אל ידיד כתב טוויין כי מטרתו ב'נסיך' וב'אופר' היתה "להעניק למשמעות המבינה את חומרת החוקים של אותו יום על ידי גרימת עונשים אחדים על המלך עצמו ומתן הזדמנות כדי לראות את כל השאר חלים על אחרים - כל זה הוא להסביר עבור מתון מסוים אשר הבדיל שלטונו של אדוארד השישי מן אלה שקדמו אחריו ". לקבלת מידע נוסף על אדוארד השישי או ההיסטוריה של שושלת טיודור, בקר הקישורים לְהַלָן.
