Freak the Mighty to historia Maxa Kane'a, siódmoklasisty, który jest po ojcu, ponieważ jest bardzo wysoki. Mimo że wygląda jak dorosły, Max ma kłopoty w szkole i ma trudności z zaliczeniem każdej klasy. Ma niezdiagnozowane trudności w uczeniu się połączone z traumą spowodowaną utratą matki do przemocy w młodym wieku. Jednak kiedy Max poznaje Kevina „Freaka” Avery'ego, jego życie zaczyna się zmieniać.
Kevin, nazywany Freak, jest niezwykle niski jak na swój wiek, ma zaledwie metr wzrostu w siódmej klasie. Cierpi na rzadką chorobę genetyczną, która utrudnia chodzenie, ma ortezy i kule na nogi. Jednak pomimo swojego wzrostu Freak jest niezwykle oczytany i ma zdumiewające słownictwo. Wydaje się, że Freak wie wszystko o wszystkim! Szczególnie lubi literaturę i historie przygodowe, np. O „Królu Arturze”. Obaj chłopcy mają trudności z poruszaniem się po świecie gimnazjum i nawiązują niezwykłą przyjaźń.
Max i Freak tworzą bliską więź i wspólnie przeżywają wiele przygód. Max często nosi Freaka na swoich ramionach, dzięki czemu zyskują przydomek „Freak the Mighty”, ponieważ razem są nie do powstrzymania. Przechytrzają łobuzów i uczęszczają na wszystkie ich zajęcia, a Freak pomaga Maxowi w końcu nauczyć się czytać i pisać. Freak mówi Maxowi, że pewnego dnia dostanie „bioniczne” ciało, które pomoże mu w jego stanie. Jedna z przygód Maxa i Freaka prowadzi ich do domu Iggy'ego i Loretty Lee, dwóch byłych przestępców, którzy po raz pierwszy ujawniają Freakowi (i czytelnikowi), że tatą Maxa jest Kenny „Killer” Kane i siedzi w więzieniu za morderstwo.
Ojciec Maxa zabił swoją matkę, gdy Max miał zaledwie cztery lata. Od tamtej pory Kane przebywa w więzieniu, ale mimo protestów dziadków Maxa może ubiegać się o zwolnienie warunkowe. Pewnej nocy, kiedy Max śpi, Kane porywa go i zmusza go do pójścia z nim do apartamentowca Iggy'ego i Loretty w rzędzie zaniedbanych kamienic. Kane wiąże swojego syna, mówiąc mu, że przez te wszystkie lata był niesprawiedliwie uwięziony i że nigdy nikogo nie zamordował. Kiedy Max mówi ojcu, że wie, że zabił swoją matkę, że doskonale to pamięta, Kane wpada w szał. Kane ma zamiar zabić Maxa i Loretta, którzy próbowali przyjść mu z pomocą. W szokującym momencie Freak wpada przez okno, przychodząc na ratunek, przechytrzając Kenny'ego pistoletem na wodę!
Przybywa policja, a ojciec Maxa zostaje odesłany z powrotem do więzienia. Jednak ich ulga jest krótkotrwała, gdy wkrótce potem Freak doznaje ataku i zostaje przewieziony do szpitala. To w szpitalu Max dowiaduje się, że opowieść Freaka o ciele „bionicznym” była właśnie tym - historią. Wiedział, że nie przeżyje swojego stanu, który nazywa się zespołem Morquio, ale chciał dać Maxowi nadzieję. Zanim Freak umrze, daje Maxowi pusty zeszyt, w którym każe mu opisać wszystkie ich wspólne przygody.
Max bardzo mocno znosi odejście Freaka. Jest przygnębiony przez około rok, zanim w końcu zbiera się na odwagę, by wyjąć pusty zeszyt, który dał mu Freak i zacząć pisać. To właśnie tutaj czytelnik zdaje sobie sprawę, że książka, którą czytaliśmy, jest właśnie taka: Max w końcu kieruje swój smutek na pisanie o „nieugiętej” przyjaźni jego i Freaka i ich epickich przygodach.